现在的疫苗制作都是非常精良的，基本上没有明显的副作用，但是仍然可能会有一些不良反应，所以一般建议在接种HPV疫苗前不要有感冒、咳嗽、发热等不适症状。如果有，可以先治疗，然后再接种疫苗。
接种后可能会发生一些不良反应，比如接种部位的红肿、硬结、压痛，有的人可能还会出现发热症状，严重的可能会出现全身酸痛、像感冒一样的症状，这些症状都是正常的反应，一般都可以自我恢复。如果比较严重，也可以考虑吃解热镇痛的药物。疫苗接种接触的过程中，如果发现怀孕，可以停止接种，对胎儿没有明显的影响，不需要特别的担心。